Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psen1P49769 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psen1P49769 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psen1P49769 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psen1P49769 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psen1P49769 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psen1P49769 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psen1P49769 AV099323-201ENSMUST00000124336 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psen1P49769 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms