Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms