Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VdrP48281 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VdrP48281 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VdrP48281 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VdrP48281 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VdrP48281 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VdrP48281 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VdrP48281 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
VdrP48281 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VdrP48281 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VdrP48281 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
VdrP48281 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VdrP48281 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VdrP48281 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VdrP48281 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VdrP48281 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VdrP48281 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VdrP48281 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VdrP48281 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VdrP48281 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VdrP48281 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VdrP48281 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
VdrP48281 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VdrP48281 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VdrP48281 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VdrP48281 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VdrP48281 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VdrP48281 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VdrP48281 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VdrP48281 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VdrP48281 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VdrP48281 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VdrP48281 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VdrP48281 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VdrP48281 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VdrP48281 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VdrP48281 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VdrP48281 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
VdrP48281 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VdrP48281 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
VdrP48281 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VdrP48281 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
VdrP48281 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VdrP48281 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
VdrP48281 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VdrP48281 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VdrP48281 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VdrP48281 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VdrP48281 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VdrP48281 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VdrP48281 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VdrP48281 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VdrP48281 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VdrP48281 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VdrP48281 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VdrP48281 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VdrP48281 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VdrP48281 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VdrP48281 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VdrP48281 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VdrP48281 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VdrP48281 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VdrP48281 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VdrP48281 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VdrP48281 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VdrP48281 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VdrP48281 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VdrP48281 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VdrP48281 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VdrP48281 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VdrP48281 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VdrP48281 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VdrP48281 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VdrP48281 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VdrP48281 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VdrP48281 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VdrP48281 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VdrP48281 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VdrP48281 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VdrP48281 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VdrP48281 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VdrP48281 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VdrP48281 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VdrP48281 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VdrP48281 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VdrP48281 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VdrP48281 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VdrP48281 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VdrP48281 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VdrP48281 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VdrP48281 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VdrP48281 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VdrP48281 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VdrP48281 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VdrP48281 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VdrP48281 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VdrP48281 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VdrP48281 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VdrP48281 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VdrP48281 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms