Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ItgavP43406 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ItgavP43406 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ItgavP43406 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ItgavP43406 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ItgavP43406 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ItgavP43406 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms