Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ThpoP40226 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ThpoP40226 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ThpoP40226 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ThpoP40226 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ThpoP40226 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ThpoP40226 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ThpoP40226 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ThpoP40226 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ThpoP40226 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ThpoP40226 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ThpoP40226 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ThpoP40226 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
ThpoP40226 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ThpoP40226 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ThpoP40226 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ThpoP40226 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ThpoP40226 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ThpoP40226 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
ThpoP40226 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ThpoP40226 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ThpoP40226 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ThpoP40226 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ThpoP40226 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ThpoP40226 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ThpoP40226 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ThpoP40226 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ThpoP40226 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ThpoP40226 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ThpoP40226 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ThpoP40226 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ThpoP40226 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ThpoP40226 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms