Protein–RNA interactions for Protein: P39447

Tjp1, Tight junction protein ZO-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tjp1P39447 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tjp1P39447 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms