Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms