Protein–RNA interactions for Protein: P30285

Cdk4, Cyclin-dependent kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk4P30285 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk4P30285 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms