Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms