Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprmP28828 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprmP28828 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprmP28828 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PtprmP28828 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PtprmP28828 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PtprmP28828 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
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PtprmP28828 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprmP28828 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprmP28828 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprmP28828 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprmP28828 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprmP28828 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprmP28828 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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