Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RxraP28700 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RxraP28700 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RxraP28700 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RxraP28700 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RxraP28700 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RxraP28700 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RxraP28700 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RxraP28700 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RxraP28700 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RxraP28700 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RxraP28700 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RxraP28700 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RxraP28700 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
RxraP28700 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RxraP28700 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RxraP28700 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RxraP28700 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RxraP28700 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RxraP28700 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RxraP28700 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RxraP28700 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RxraP28700 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RxraP28700 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RxraP28700 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RxraP28700 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RxraP28700 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RxraP28700 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RxraP28700 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RxraP28700 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxraP28700 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxraP28700 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxraP28700 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxraP28700 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxraP28700 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxraP28700 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxraP28700 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxraP28700 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxraP28700 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxraP28700 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxraP28700 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxraP28700 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxraP28700 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxraP28700 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxraP28700 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxraP28700 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxraP28700 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxraP28700 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxraP28700 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxraP28700 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxraP28700 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxraP28700 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxraP28700 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxraP28700 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxraP28700 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxraP28700 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxraP28700 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxraP28700 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxraP28700 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxraP28700 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxraP28700 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxraP28700 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxraP28700 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxraP28700 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxraP28700 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RxraP28700 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxraP28700 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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RxraP28700 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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RxraP28700 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxraP28700 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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RxraP28700 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxraP28700 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxraP28700 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxraP28700 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxraP28700 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxraP28700 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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RxraP28700 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RxraP28700 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RxraP28700 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxraP28700 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxraP28700 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxraP28700 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxraP28700 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxraP28700 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxraP28700 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxraP28700 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxraP28700 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RxraP28700 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxraP28700 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxraP28700 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxraP28700 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxraP28700 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RxraP28700 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxraP28700 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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