Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vav1P27870 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vav1P27870 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vav1P27870 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vav1P27870 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vav1P27870 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vav1P27870 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vav1P27870 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vav1P27870 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vav1P27870 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vav1P27870 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vav1P27870 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vav1P27870 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms