Protein–RNA interactions for Protein: P25976

Ubtf, Nucleolar transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbtfP25976 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UbtfP25976 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UbtfP25976 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UbtfP25976 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UbtfP25976 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UbtfP25976 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UbtfP25976 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UbtfP25976 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UbtfP25976 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UbtfP25976 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UbtfP25976 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UbtfP25976 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UbtfP25976 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UbtfP25976 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UbtfP25976 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UbtfP25976 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UbtfP25976 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UbtfP25976 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UbtfP25976 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
UbtfP25976 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UbtfP25976 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UbtfP25976 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UbtfP25976 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UbtfP25976 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UbtfP25976 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UbtfP25976 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UbtfP25976 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UbtfP25976 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UbtfP25976 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UbtfP25976 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UbtfP25976 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UbtfP25976 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UbtfP25976 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
UbtfP25976 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
UbtfP25976 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UbtfP25976 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms