Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk11bP24788 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk11bP24788 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk11bP24788 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk11bP24788 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk11bP24788 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk11bP24788 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk11bP24788 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk11bP24788 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk11bP24788 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk11bP24788 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk11bP24788 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk11bP24788 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk11bP24788 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk11bP24788 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk11bP24788 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk11bP24788 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk11bP24788 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk11bP24788 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms