Protein–RNA interactions for Protein: P23804

Mdm2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdm2P23804 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mdm2P23804 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Mdm2P23804 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mdm2P23804 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mdm2P23804 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mdm2P23804 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Mdm2P23804 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mdm2P23804 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mdm2P23804 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mdm2P23804 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mdm2P23804 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mdm2P23804 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mdm2P23804 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mdm2P23804 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mdm2P23804 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mdm2P23804 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mdm2P23804 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mdm2P23804 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mdm2P23804 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mdm2P23804 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mdm2P23804 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mdm2P23804 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mdm2P23804 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mdm2P23804 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mdm2P23804 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mdm2P23804 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mdm2P23804 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mdm2P23804 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Mdm2P23804 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mdm2P23804 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms