Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms