Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RarbP22605 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RarbP22605 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RarbP22605 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RarbP22605 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RarbP22605 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RarbP22605 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RarbP22605 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RarbP22605 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RarbP22605 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RarbP22605 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RarbP22605 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RarbP22605 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RarbP22605 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RarbP22605 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RarbP22605 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RarbP22605 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RarbP22605 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RarbP22605 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RarbP22605 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RarbP22605 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RarbP22605 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RarbP22605 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RarbP22605 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RarbP22605 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RarbP22605 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RarbP22605 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RarbP22605 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RarbP22605 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RarbP22605 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RarbP22605 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RarbP22605 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RarbP22605 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RarbP22605 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RarbP22605 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RarbP22605 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RarbP22605 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RarbP22605 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RarbP22605 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RarbP22605 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RarbP22605 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RarbP22605 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RarbP22605 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RarbP22605 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RarbP22605 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RarbP22605 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RarbP22605 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RarbP22605 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RarbP22605 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RarbP22605 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RarbP22605 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RarbP22605 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RarbP22605 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RarbP22605 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RarbP22605 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RarbP22605 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RarbP22605 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RarbP22605 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RarbP22605 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RarbP22605 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RarbP22605 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RarbP22605 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RarbP22605 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RarbP22605 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RarbP22605 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RarbP22605 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RarbP22605 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RarbP22605 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RarbP22605 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RarbP22605 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RarbP22605 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RarbP22605 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RarbP22605 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RarbP22605 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RarbP22605 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RarbP22605 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RarbP22605 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RarbP22605 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RarbP22605 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RarbP22605 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RarbP22605 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RarbP22605 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RarbP22605 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RarbP22605 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RarbP22605 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RarbP22605 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RarbP22605 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RarbP22605 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RarbP22605 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RarbP22605 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RarbP22605 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RarbP22605 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RarbP22605 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RarbP22605 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RarbP22605 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RarbP22605 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RarbP22605 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RarbP22605 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RarbP22605 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RarbP22605 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms