Protein–RNA interactions for Protein: P22227

Zfp42, Zinc finger protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp42P22227 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp42P22227 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms