Protein–RNA interactions for Protein: P21275

Bmp4, Bone morphogenetic protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp4P21275 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms