Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms