Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ms4a2P20490 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ms4a2P20490 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ms4a2P20490 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ms4a2P20490 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ms4a2P20490 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ms4a2P20490 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ms4a2P20490 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ms4a2P20490 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ms4a2P20490 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ms4a2P20490 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ms4a2P20490 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ms4a2P20490 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ms4a2P20490 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ms4a2P20490 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ms4a2P20490 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ms4a2P20490 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ms4a2P20490 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ms4a2P20490 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ms4a2P20490 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ms4a2P20490 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ms4a2P20490 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ms4a2P20490 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ms4a2P20490 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ms4a2P20490 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ms4a2P20490 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ms4a2P20490 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ms4a2P20490 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ms4a2P20490 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ms4a2P20490 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ms4a2P20490 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ms4a2P20490 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ms4a2P20490 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ms4a2P20490 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ms4a2P20490 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ms4a2P20490 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ms4a2P20490 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ms4a2P20490 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ms4a2P20490 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ms4a2P20490 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ms4a2P20490 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ms4a2P20490 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ms4a2P20490 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ms4a2P20490 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ms4a2P20490 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ms4a2P20490 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ms4a2P20490 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ms4a2P20490 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ms4a2P20490 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ms4a2P20490 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ms4a2P20490 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ms4a2P20490 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ms4a2P20490 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ms4a2P20490 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ms4a2P20490 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ms4a2P20490 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ms4a2P20490 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ms4a2P20490 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms