Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms