Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pou5f1P20263 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Pou5f1P20263 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pou5f1P20263 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou5f1P20263 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pou5f1P20263 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou5f1P20263 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pou5f1P20263 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou5f1P20263 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms