Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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