Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NefhP19246 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NefhP19246 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NefhP19246 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NefhP19246 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NefhP19246 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NefhP19246 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NefhP19246 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NefhP19246 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NefhP19246 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NefhP19246 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NefhP19246 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NefhP19246 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NefhP19246 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NefhP19246 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NefhP19246 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NefhP19246 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NefhP19246 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NefhP19246 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NefhP19246 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NefhP19246 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NefhP19246 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NefhP19246 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NefhP19246 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NefhP19246 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NefhP19246 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NefhP19246 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NefhP19246 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NefhP19246 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NefhP19246 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NefhP19246 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NefhP19246 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NefhP19246 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NefhP19246 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NefhP19246 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NefhP19246 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NefhP19246 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NefhP19246 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NefhP19246 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NefhP19246 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NefhP19246 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NefhP19246 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NefhP19246 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NefhP19246 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NefhP19246 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NefhP19246 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NefhP19246 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NefhP19246 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NefhP19246 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NefhP19246 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NefhP19246 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NefhP19246 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NefhP19246 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NefhP19246 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NefhP19246 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NefhP19246 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NefhP19246 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NefhP19246 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NefhP19246 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NefhP19246 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NefhP19246 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NefhP19246 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NefhP19246 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NefhP19246 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NefhP19246 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NefhP19246 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NefhP19246 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NefhP19246 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NefhP19246 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NefhP19246 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NefhP19246 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NefhP19246 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NefhP19246 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NefhP19246 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NefhP19246 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NefhP19246 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NefhP19246 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NefhP19246 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NefhP19246 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NefhP19246 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NefhP19246 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NefhP19246 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NefhP19246 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NefhP19246 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NefhP19246 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NefhP19246 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NefhP19246 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NefhP19246 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NefhP19246 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NefhP19246 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NefhP19246 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NefhP19246 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NefhP19246 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NefhP19246 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NefhP19246 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NefhP19246 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NefhP19246 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NefhP19246 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NefhP19246 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NefhP19246 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms