Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms