Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms