Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P18528 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
P18528 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
P18528 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
P18528 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
P18528 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P18528 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P18528 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P18528 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P18528 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P18528 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P18528 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P18528 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P18528 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P18528 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
P18528 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P18528 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P18528 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P18528 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P18528 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P18528 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P18528 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P18528 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P18528 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P18528 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12□□□□□ -0.49
P18528 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P18528 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC12□□□□□ -0.49
P18528 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P18528 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
P18528 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P18528 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
P18528 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
P18528 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P18528 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
P18528 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P18528 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P18528 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P18528 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P18528 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P18528 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12□□□□□ -0.49
P18528 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P18528 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P18528 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P18528 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P18528 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P18528 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P18528 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P18528 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P18528 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P18528 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18528 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18528 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18528 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18528 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18528 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18528 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18528 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18528 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18528 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
P18528 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
P18528 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18528 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18528 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18528 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18528 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18528 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18528 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18528 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18528 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18528 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18528 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18528 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18528 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18528 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18528 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18528 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18528 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18528 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18528 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18528 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18528 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18528 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18528 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18528 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18528 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18528 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18528 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18528 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18528 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18528 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
P18528 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18528 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18528 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18528 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18528 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18528 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18528 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18528 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18528 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18528 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms