Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtpraP18052 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtpraP18052 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtpraP18052 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtpraP18052 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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PtpraP18052 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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PtpraP18052 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtpraP18052 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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PtpraP18052 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtpraP18052 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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PtpraP18052 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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PtpraP18052 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PtpraP18052 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtpraP18052 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtpraP18052 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtpraP18052 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PtpraP18052 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtpraP18052 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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