Protein–RNA interactions for Protein: P16460

Ass1, Argininosuccinate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ass1P16460 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ass1P16460 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ass1P16460 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ass1P16460 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ass1P16460 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ass1P16460 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ass1P16460 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ass1P16460 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149 ms