Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gabra6P16305 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gabra6P16305 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gabra6P16305 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gabra6P16305 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gabra6P16305 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gabra6P16305 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gabra6P16305 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gabra6P16305 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gabra6P16305 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gabra6P16305 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gabra6P16305 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gabra6P16305 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gabra6P16305 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gabra6P16305 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gabra6P16305 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gabra6P16305 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gabra6P16305 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gabra6P16305 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gabra6P16305 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gabra6P16305 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gabra6P16305 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms