Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Calb1P12658 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calb1P12658 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calb1P12658 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calb1P12658 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calb1P12658 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calb1P12658 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calb1P12658 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calb1P12658 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Calb1P12658 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calb1P12658 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calb1P12658 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms