Protein–RNA interactions for Protein: P10146

Ccl1, C-C motif chemokine 1, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl1P10146 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl1P10146 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl1P10146 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl1P10146 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl1P10146 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl1P10146 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl1P10146 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl1P10146 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl1P10146 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl1P10146 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl1P10146 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl1P10146 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms