Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms