Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms