Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dnmt3cP0DOY1 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Dnmt3cP0DOY1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dnmt3cP0DOY1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dnmt3cP0DOY1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dnmt3cP0DOY1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dnmt3cP0DOY1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dnmt3cP0DOY1 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dnmt3cP0DOY1 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dnmt3cP0DOY1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dnmt3cP0DOY1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dnmt3cP0DOY1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dnmt3cP0DOY1 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dnmt3cP0DOY1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dnmt3cP0DOY1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dnmt3cP0DOY1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dnmt3cP0DOY1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dnmt3cP0DOY1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dnmt3cP0DOY1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dnmt3cP0DOY1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dnmt3cP0DOY1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dnmt3cP0DOY1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dnmt3cP0DOY1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dnmt3cP0DOY1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dnmt3cP0DOY1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dnmt3cP0DOY1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dnmt3cP0DOY1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dnmt3cP0DOY1 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dnmt3cP0DOY1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dnmt3cP0DOY1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dnmt3cP0DOY1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dnmt3cP0DOY1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dnmt3cP0DOY1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dnmt3cP0DOY1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dnmt3cP0DOY1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dnmt3cP0DOY1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dnmt3cP0DOY1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dnmt3cP0DOY1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dnmt3cP0DOY1 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dnmt3cP0DOY1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Dnmt3cP0DOY1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dnmt3cP0DOY1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dnmt3cP0DOY1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dnmt3cP0DOY1 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Dnmt3cP0DOY1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Dnmt3cP0DOY1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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