Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itgb1P09055 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itgb1P09055 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itgb1P09055 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itgb1P09055 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itgb1P09055 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itgb1P09055 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itgb1P09055 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itgb1P09055 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itgb1P09055 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Itgb1P09055 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itgb1P09055 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itgb1P09055 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itgb1P09055 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itgb1P09055 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Itgb1P09055 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itgb1P09055 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itgb1P09055 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itgb1P09055 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Itgb1P09055 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb1P09055 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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