Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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