Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms