Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Spta1P08032 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Spta1P08032 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Spta1P08032 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Spta1P08032 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Spta1P08032 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Spta1P08032 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Spta1P08032 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spta1P08032 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spta1P08032 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Spta1P08032 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Spta1P08032 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Spta1P08032 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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