Protein–RNA interactions for Protein: P06837

Gap43, Neuromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gap43P06837 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gap43P06837 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gap43P06837 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gap43P06837 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gap43P06837 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gap43P06837 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gap43P06837 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gap43P06837 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gap43P06837 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gap43P06837 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gap43P06837 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gap43P06837 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms