Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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PdgfrbP05622 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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PdgfrbP05622 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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PdgfrbP05622 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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PdgfrbP05622 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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PdgfrbP05622 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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PdgfrbP05622 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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PdgfrbP05622 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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PdgfrbP05622 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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PdgfrbP05622 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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PdgfrbP05622 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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PdgfrbP05622 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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PdgfrbP05622 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfrbP05622 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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