Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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