Protein–RNA interactions for Protein: P01789

Ig heavy chain V region M603, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01789 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01789 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01789 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01789 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01789 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P01789 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01789 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01789 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01789 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01789 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01789 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01789 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01789 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01789 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01789 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01789 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01789 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01789 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01789 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01789 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01789 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01789 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01789 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01789 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01789 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01789 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01789 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01789 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01789 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01789 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01789 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01789 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01789 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01789 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01789 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01789 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01789 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
P01789 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01789 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01789 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01789 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01789 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01789 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01789 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01789 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01789 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01789 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01789 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01789 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01789 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01789 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01789 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01789 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01789 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01789 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01789 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01789 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01789 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01789 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01789 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01789 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01789 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01789 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01789 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01789 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01789 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01789 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01789 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01789 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01789 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01789 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01789 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01789 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01789 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01789 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P01789 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P01789 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01789 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01789 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01789 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01789 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01789 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01789 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01789 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01789 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01789 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01789 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01789 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01789 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01789 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01789 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01789 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01789 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01789 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01789 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01789 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01789 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01789 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01789 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01789 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms