Protein–RNA interactions for Protein: P01757

Ig heavy chain V region J558, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01757 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01757 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
P01757 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01757 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01757 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01757 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
P01757 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01757 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01757 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01757 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01757 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01757 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01757 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01757 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01757 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01757 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01757 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01757 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01757 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01757 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01757 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01757 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01757 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01757 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01757 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
P01757 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01757 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01757 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
P01757 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01757 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01757 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01757 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01757 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01757 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01757 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01757 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01757 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01757 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01757 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01757 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01757 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01757 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
P01757 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01757 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01757 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01757 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01757 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01757 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
P01757 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01757 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01757 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01757 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01757 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01757 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01757 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01757 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01757 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01757 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01757 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01757 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01757 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01757 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01757 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01757 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01757 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01757 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01757 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01757 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01757 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01757 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01757 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01757 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01757 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01757 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
P01757 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01757 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01757 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01757 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01757 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01757 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01757 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01757 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01757 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01757 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01757 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01757 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01757 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01757 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
P01757 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
P01757 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
P01757 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01757 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01757 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01757 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01757 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01757 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01757 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01757 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
P01757 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01757 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms