Protein–RNA interactions for Protein: O89104

Sypl2, Synaptophysin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl2O89104 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sypl2O89104 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms