Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CopeO89079 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CopeO89079 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CopeO89079 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CopeO89079 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CopeO89079 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CopeO89079 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CopeO89079 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CopeO89079 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CopeO89079 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CopeO89079 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CopeO89079 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CopeO89079 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CopeO89079 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CopeO89079 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CopeO89079 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CopeO89079 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CopeO89079 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CopeO89079 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CopeO89079 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CopeO89079 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CopeO89079 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CopeO89079 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CopeO89079 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CopeO89079 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CopeO89079 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CopeO89079 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CopeO89079 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CopeO89079 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CopeO89079 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CopeO89079 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CopeO89079 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CopeO89079 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CopeO89079 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CopeO89079 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CopeO89079 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CopeO89079 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CopeO89079 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CopeO89079 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CopeO89079 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CopeO89079 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CopeO89079 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CopeO89079 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CopeO89079 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CopeO89079 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CopeO89079 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CopeO89079 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CopeO89079 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CopeO89079 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CopeO89079 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CopeO89079 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CopeO89079 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CopeO89079 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CopeO89079 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CopeO89079 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CopeO89079 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CopeO89079 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CopeO89079 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CopeO89079 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CopeO89079 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CopeO89079 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CopeO89079 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CopeO89079 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CopeO89079 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CopeO89079 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CopeO89079 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CopeO89079 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CopeO89079 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CopeO89079 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CopeO89079 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CopeO89079 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CopeO89079 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CopeO89079 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CopeO89079 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CopeO89079 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CopeO89079 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CopeO89079 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CopeO89079 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CopeO89079 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CopeO89079 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CopeO89079 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CopeO89079 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CopeO89079 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CopeO89079 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CopeO89079 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CopeO89079 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CopeO89079 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CopeO89079 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CopeO89079 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CopeO89079 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CopeO89079 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CopeO89079 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CopeO89079 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CopeO89079 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CopeO89079 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CopeO89079 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CopeO89079 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CopeO89079 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CopeO89079 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CopeO89079 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms