Protein–RNA interactions for Protein: O88834

Shd, SH2 domain-containing adapter protein D, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShdO88834 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ShdO88834 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ShdO88834 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ShdO88834 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ShdO88834 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ShdO88834 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ShdO88834 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ShdO88834 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ShdO88834 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ShdO88834 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ShdO88834 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ShdO88834 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ShdO88834 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ShdO88834 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ShdO88834 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ShdO88834 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ShdO88834 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ShdO88834 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ShdO88834 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ShdO88834 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ShdO88834 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ShdO88834 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ShdO88834 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ShdO88834 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ShdO88834 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ShdO88834 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ShdO88834 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ShdO88834 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ShdO88834 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ShdO88834 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ShdO88834 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ShdO88834 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ShdO88834 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ShdO88834 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ShdO88834 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ShdO88834 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ShdO88834 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ShdO88834 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ShdO88834 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ShdO88834 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ShdO88834 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ShdO88834 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ShdO88834 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ShdO88834 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ShdO88834 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ShdO88834 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ShdO88834 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ShdO88834 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ShdO88834 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ShdO88834 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ShdO88834 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ShdO88834 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ShdO88834 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ShdO88834 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ShdO88834 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ShdO88834 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ShdO88834 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ShdO88834 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ShdO88834 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ShdO88834 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ShdO88834 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ShdO88834 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ShdO88834 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ShdO88834 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ShdO88834 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ShdO88834 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ShdO88834 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ShdO88834 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ShdO88834 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ShdO88834 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ShdO88834 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ShdO88834 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ShdO88834 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ShdO88834 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ShdO88834 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ShdO88834 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ShdO88834 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ShdO88834 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ShdO88834 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ShdO88834 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ShdO88834 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ShdO88834 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ShdO88834 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ShdO88834 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ShdO88834 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ShdO88834 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ShdO88834 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ShdO88834 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ShdO88834 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ShdO88834 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ShdO88834 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ShdO88834 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ShdO88834 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ShdO88834 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ShdO88834 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ShdO88834 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ShdO88834 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ShdO88834 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ShdO88834 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ShdO88834 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms