Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3aO88508 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3aO88508 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3aO88508 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3aO88508 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3aO88508 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3aO88508 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3aO88508 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3aO88508 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3aO88508 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3aO88508 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3aO88508 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3aO88508 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3aO88508 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3aO88508 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3aO88508 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3aO88508 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3aO88508 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3aO88508 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3aO88508 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3aO88508 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3aO88508 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3aO88508 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3aO88508 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3aO88508 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3aO88508 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3aO88508 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3aO88508 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3aO88508 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3aO88508 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3aO88508 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3aO88508 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3aO88508 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3aO88508 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3aO88508 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3aO88508 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms