Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms